为什么XL-MS加速药物靶点发现

药物靶点发现是寻找新药应作用的人体特定分子的过程。成功的癌症治疗、许多激酶抑制剂以及像PD-1/PD-L1抗体这样的免疫检查点药物，都始于药物靶点发现的突破。研究人员寻找驱动疾病的蛋白质，验证其作用，然后设计小分子或生物制剂来调节它们。然而，随着疾病变得更加复杂，传统方法往往难以在恰当的时间揭示正确的靶点。我们如何在真实生物环境中更清晰地观察蛋白质相互作用，并更快地从候选目标到确认靶点？这时XL-MS开始改变游戏规则......

（免疫检查点抑制剂——NCI）

观察药物靶点 我在它们的真实交互网络中

XL-MS（交联质谱仪） 这个想法很简单：如果两个蛋白质足够靠近，交联剂可以把它们锁在一起。一旦形成了这个链，质谱仪就能检测到交联肽，并告诉你蛋白质的哪些区域参与其中。

实际上，这意味着你可以直接将交联试剂添加到细胞裂解液或纯化复合物中。这些试剂在附近的氨基酸之间形成共价键，有效地“冻结”蛋白质相互作用。重要的是，这包括弱、短暂或依赖条件的相互作用，这些相互作用常在净化或清洗步骤中消失。

对于药物靶点发现，这种细节层面极为宝贵。大多数药物靶点都存在于大型多蛋白复合物或信号通路中。如果你只知道单一蛋白质的结构，你只看到故事的一部分。使用XL-MS时，你可以：

•绘制哪些蛋白质与目标直接相互作用

• 定位参与相互作用的近似结合位点或结构域

• 比较健康样本与疾病样本之间的相互作用模式

• 跟踪候选化合物如何干扰或稳定特定接触

XL-MS还能很好地结合结构方法如冷冻电磁和X射线晶体学。结构生物学能提供高分辨率的快照。XL-MS增加了距离约束和交互模式，有助于验证或完善模型，尤其是对于难以解析的柔性区域。它们共同提供了更真实的药物靶点在拥挤分子环境中的表现图景。

为什么XL-MS适合现代药物靶点发现流程

许多团队告诉我们同样的话：他们希望对蛋白质相互作用有更深入的洞察，但他们不能接受会拖慢整个项目进程的方法。XL-MS的吸引力在于它提供丰富的生物学信息，而无需对工作流程进行彻底重设计。

日常项目中有一些显著的实际优势：

•高通量，高信息内容

XL-MS非常适合复杂样本和大型研究。一旦交联和消化得到优化，先进的质谱仪可以在一次运行中处理大量样品。自动化数据处理随后将原始光谱转化为交互图，帮助团队更快地从实验到解读。

•在更本土的环境中的作品

由于交联可以在细胞或近生理环境中进行，因此你不必局限于高度纯化的蛋白质。这可以捕捉到仅在特定条件下形成的相互作用，比如辅因子的存在、膜环境或疾病相关的应激信号。对于药物靶点发现，这意味着候选药物会在更贴近体内实际情况的环境中进行评估。

• 无需特殊蛋白标记

XL-MS不需要在每个蛋白质上定制化学标签或遗传标签。这降低了实验复杂性，避免了标记时产生的伪影，并使得跨多个目标和条件的扩展变得更容易。

• 对弱相互作用和瞬态相互作用敏感

一些最重要的调控事件涉及低亲和力或短暂的复合物。这些正是传统拉下或纯净技术可能消除的互动类型。交联能在药物发生的瞬间捕捉它们，为你提供更完整的相互作用网络，帮助你避免药物靶点发现中的盲点。

综合来看，这些优势使研究团队能够更智能地优先排序目标。你可以不仅关注易于测量的事物，而是关注具有生物学意义的事物——同时还能控制时间表和预算。

（多靶点定向配体与脂质组学方法在胶质母细胞瘤药物发现中的研究）

Longlight 技术如何支持端到端的 XL-MS 工作流程

在Longlight Technology，我们将XL-MS定位为药物靶点发现综合解决方案的一部分，而非单一实验。许多团队内部没有足够的资源从零构建完整的XL-MS流水线，因此我们设计服务以接入您现有的研究流程。

您可以选择发送预交联样本，或与我们的科学家合作，制定适合您系统的交联策略——选择合适的交联剂、病况和对照。随后，Longlight Technology负责所有技术环节，包括样品消化、交联肽富集、质谱采集和数据分析。您将获得一份清晰、项目准备的报告，绘制蛋白质相互作用伙伴图谱，识别交联位点，并提取与目标和作用机制决策最相关的结构信息。

除了XL-MS，Longlight Technology还支持药物靶点发现相关的上游和下游工作。我们的基因组学解决方案，包括下一代测序相关仪器和试剂，帮助您识别与疾病途径相关的遗传变异、表达变化和调控要素。如ChIP-seq等技术将蛋白质-DNA相互作用与XL-MS生成的蛋白质-蛋白质相互作用图谱连接起来，让您更广泛地了解靶点在染色质调控和转录网络中的定位。

为了让您的实验室顺利运行，我们还提供一系列消耗品和套件——如核酸提取套件、文库制备套件、预制琼脂糖凝胶和专用管材——这些产品设计用于科研和生物制药环境中的日常稳定使用。使命是简化每一个阶段——准备、测量和分析——让科学家们减少设置和排查的时间，更多时间检验重要的假设。将XL-MS用于相互作用图谱、基因组学平台和稳定实验室工具的结合，带来了更协调且高效的药物靶点发现工作流程。你不是孤立实验，而是建立一个持续将更好数据输送到更好决策的管道。

如果您的组织希望缩短发现周期、降低风险，并更清晰地了解潜在药物靶点在真实生物系统中的行为，我们非常乐意为您提供支持。

有兴趣在下一个药物靶点发现项目中探索XL-MS吗？

请联系Longlight Technology，讨论您的目标、样本或研究设计，让我们帮助您将复杂的蛋白质相互作用数据转化为具体、可作的见解。